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深海科學(xué)與工程研究所
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2018

深淵細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)無(wú)修飾反義密碼子

文章來(lái)源:  |  發(fā)布時(shí)間:2018-02-03  |  【打印】 【關(guān)閉

  
  2018年1月30日,國(guó)際權(quán)威雜志《Nucleic Acids Res》(影響因子10.1)在線發(fā)表了深海所深海微生物基因組王勇研究員為第一和共同通訊作者的文章“Unique tRNA gene profile suggests paucity of nucleotide modifications in anticodons of a deep-sea symbiotic Spiroplasma”。該文發(fā)現(xiàn)了自然界普遍存在的反義密碼子修飾在深淵螺原菌中消失,取而代之的是一種全新的反義密碼子基因組合,從而暗示深淵生命體中的基因翻譯過(guò)程受到高靜水壓的影響。文章中的細(xì)菌是“蛟龍?zhí)枴?016年馬里亞納海溝深淵潛次中獲得的海參的腸道共生菌,深度6200米。基因到蛋白的翻譯過(guò)程是所有生命的基本過(guò)程,任何新的發(fā)現(xiàn)都會(huì)對(duì)現(xiàn)有的生物學(xué)理論框架造成沖擊。該文雖然認(rèn)為這一現(xiàn)象可能是進(jìn)化末端,而不具有普遍性,但是深海極端環(huán)境對(duì)這一進(jìn)化起到了推動(dòng)作用,使失去了修飾的反義密碼子的細(xì)菌依然可以在高壓下維持翻譯過(guò)程中密碼子與反義密碼子的三維構(gòu)象。文中也提出深海或許存在更多跟生物學(xué)教科書(shū)不同的生命現(xiàn)象。

  

  左圖:深淵共生螺原菌的全新反義密碼子基因(由實(shí)心點(diǎn)對(duì)應(yīng))

  右圖:比較其他細(xì)菌的反義密碼子基因和密碼子使用頻率

  Y. Wang*, FC Zhu, LS He, A. Danchin*. 2018. Unique tRNA gene profile suggests paucity of nucleotide modifications in anticodons of a deep-sea symbiotic Spiroplasma. Nucleic Acids Research, gky045.

  https://doi.org/10.1093/nar/gky045

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